1.外界對同一交易行為須核課印花稅及營業稅等稅目，時有重複課稅疑慮。
2.徵納雙方對於是否構成課稅憑證及究屬何類課稅憑證，時有爭議。
3.印花稅採貼花或彙總申報完稅方式不易控管，易生逃漏。
4.主張合約於國外簽訂以規避稅負。
5.印花稅稅源可跨縣市流動，造成地方政府間爭稅情形。
廢止印花稅可消除納稅義務人交易過程之干擾並降低交易成本，對於促進經濟成長有正面助益，爰依中央法規標準法第21條第2款規定，擬予廢止，俾全民受惠。
財政部進一步說明，印花稅法廢止案業經行政院今日院會通過，行政院將核轉立法院審議，該部將積極與立法院朝野各黨團溝通，俾早日完成廢止程序。鑑於印花稅屬100%直轄市及縣（市）收入，倘經立法院審議廢止印花稅法，未及納編預算之年度先由行政院主計總處衡酌中央政府財源，統籌規劃補足各地方政府減少之稅收；嗣後年度則由財政部編列預算作為替代財源，未來納入財政收支劃分法修正草案通盤處理。
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