該局指出，依兼營營業人營業稅額計算辦法第8條之1第1項規定「兼營營業人帳簿記載完備，能明確區分所購買貨物、勞務或進口貨物之實際用途者，得採用直接扣抵法，按貨物或勞務之實際用途計算進項稅額可扣抵銷項稅額之金額」。另依同法第8條之2第1款規定，採用直接扣抵法之兼營營業人應將購買貨物、勞務或進口貨物、購買國外勞務之用途區分為專供應稅、或專供免稅、或專供共同使用，並於帳簿上明確記載。
該局舉例，甲公司有出售冷氣之收入及股利收入，於年底調整時應將購入冷氣之進項費用分攤為專供應稅營業用，因買賣股票取得之顧問費等應分攤為專供免稅營業用，另有關辦公室租金、水電費、管理費等應合理分攤為供應稅或免稅（共同使用）營業用。
該局呼籲，營業人採直接扣抵法計算進項稅額分攤，若未依實際用途合理分攤進項稅額，致有虛報進項稅額者，除追繳稅款外，依違反加值型及非加值型營業稅法第51條第5款處罰。
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