企業超額分配可扣抵稅額，導致股東因此溢扣所得稅，減少應納綜合所得稅負的行為，即日起，應處罰款將降至一倍以下。財政部說，所有尚未確定的處罰案件，都可改按較輕的罰鍰倍數繳納罰款。
兩稅合一實施之後，企業所繳納的營利事業所得稅，應該在分配股利給股東之時，一併依規定分配給股東，做為股東申報個人綜合所得稅時的扣除項目，可扣抵稅額具有節省股利稅負的效果。
財政部指出，應設置股東可扣抵稅額的營利事業，一旦超額分配可扣抵稅額給股東，目前稅捐機關都是按照超額分配的稅額，處一倍罰款，對企業開罰。
財政部已修正稅務違章案件裁罰金額或倍數參考表，對這類超額分配以致股東溢扣所得稅的案件，調降處罰倍數在一倍以下，並視其超額分配的稅額高低，分級處罰。
依照新的處罰規定，企業因分配股東的可扣抵稅額，超過其應分配數額時，其超額分配金額在3萬元以下者，按超額分配金額處0.2倍罰鍰；3萬元到10萬元間者，處0.5倍罰鍰；超過10萬元以上者，處一倍罰鍰。
舉例來說，甲公司96年度虛增股東可扣抵稅額帳戶，使得分配給股東的可扣抵稅額，超過其應分配的可扣抵稅額4萬元，若依過去規定，甲公司應處罰款4萬元；新規定因其超額分配的金額在3萬元至10萬元間，只需按超額分配金額4萬元，處0.5倍罰款，也就是2萬元。
應設置股東可扣抵稅額帳戶的企業，在分配股利時，會出現超額分配股東可扣抵稅額的原因有三種，包括：虛增股東可扣抵稅額帳戶金額，或短計帳載累積未分配盈餘金額，導致分配給股東或社員的可扣抵稅額，超過其應分配的可扣抵稅額。
另外可能因為分配給股東或社員的可扣抵稅額，超過股利或盈餘分配日，其股東可扣抵稅額帳戶餘額；以及分配股利淨額所適用的稅額扣抵比率，超過規定比率，使得所分配的可扣抵稅額，超過依規定計算的金額。
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