公司行號應注意，申報佣金支出時，若未依仲介合約的內容實際履行，則須另行提供仲介勞務的事實證明，否則光憑代理商佣金協議及統一發票，無法證明有仲介的必要性，還是會被剔除補稅。
公司申報佣金支出時，應依營利事業所得稅查核準則第92條第1款規定，提示雙方契約，或其他具居間仲介事實的相關證明文件，以供國稅局核實認定。
北區國稅局日前發現，甲公司93年度列報佣金支出147萬餘元，由於甲公司與乙公司訂立代理商佣金協議書，約定由乙公司負責與所有連絡人往來，並交訂單給甲公司，但國稅局針對乙公司進行調查時，乙公司又表示缺乏可居中下單溝通的人才，加上甲公司未能檢具仲介的資料佐證，無法證明乙公司有代理仲介勞務的事實，因此甲公司列報的147萬餘元佣金支出，被北區國稅局全數剔除補稅。
甲公司不服，主張已提示雙方合約，並依規定取得乙公司開立的統一發票、支付佣金的匯款水單及計算明細表，應符合列報佣金的規定，因此提起行政救濟，但最高行政法院仍判決甲公司敗訴。
最高行政法院判決指出，因乙公司表示內部缺乏仲介人才，因此交易是由甲公司與丙公司人員直接往來，且甲公司在以前年度已與丙公司有交易往來，顯見乙公司無法提供其他仲介勞務，甲公司並沒有和乙公司簽約的必要，也無須支付乙公司佣金，才會判決甲公司敗訴。
