北區國稅局最近發現，許多公司申報銷售額與稅額申報書時，將取得進項來源公司開立的統一發票，重複申報扣抵應納營業稅額，造成短繳應納營業稅，國稅局呼籲，申報營業稅的登錄手續要小心，以免重複列報而被補稅並加處漏稅額一倍罰款。
甲公司申報97年5-6月銷售額與稅額申報書時，將取得乙公司97年6月10日開立的統一發票銷售額160萬元、營業稅額8萬元，重複申報扣抵應納營業稅額，導致短繳應納稅額8萬元，經北區國稅局查獲，除核定補徵短繳的營業稅額8 萬元外，並處一倍罰鍰8萬元。
最近有不少公司發生類似甲公司的錯誤，北區國稅局分析，大部分都是因為會計人員疏忽，重複登錄同一筆進項的統一發票；更聽聞不少公司要求會計人員自行負擔罰鍰，對每月薪水不多的會計而言，更是天外飛來的橫禍。
北區國稅局進一步指出，今年度已發生多起類似案件，經深入了解，原來是因經濟不景氣，公司裁員或會計人員離職後，並未及時遞補人力，造成負責申報業務的人員工作負擔加重，登錄資料後沒有核對，加上使用網路報稅軟體，沒有統一發票字軌號碼檢核功能，所以才會將同一張統一發票重複建檔，而未及時發現。
