受到金融海嘯重創，大陸為彌平稅收缺口，稅局不但開始加強稅收徵管力度，更把目標鎖定個人所得稅。從6月開始，不僅個人要確實申報，連負責扣繳的公司也要盡申報責任，去年為員工先行扣繳個人所得稅款超過人民幣10萬元（約台幣47.7萬元）的企業，就要開始實行「全員全額扣繳申報」。
大陸早在2005年就已經制定個人所得稅自行納稅申報辦法，只是執行的成效不佳，因為現在稅收環境嚴峻，稅局加強個人所得稅收的徵管。一旦進行全員全額扣繳申報，業者必須每月申報所有扣繳所得的明細，讓大陸稅局可以充分掌握課稅資料，往後想要在大陸逃漏個人所得稅，恐怕難上加難。
根據大陸頒布的「個人所得稅自行納稅申報辦法」規定，只要年度所得額超過人民幣12萬元以上，應該自行申報所得稅。大陸稅局更進一步要求，今年6月開始，支付薪水的企業，只要去年度的扣繳稅款超過人民幣10萬元，就要開始實行「全員全額扣繳申報」。
資誠會計師事務所稅務暨法律服務部副總經理陳惠鈴指出，大陸並非現在才要求公司申報扣繳明細，但過去門檻比較高，2007年時，年度扣繳個人所得稅款人民幣80萬元的公司，才要納入全員全額扣繳申報管理；去年調整為30萬元；現在更調低到10萬元。
資誠會計師事務所稅務暨法律服務部營運長吳德豐解釋，所謂的「全員全額扣繳申報」，就是要求公司要申報所有支付所得的明細，不論支付的對象是否為正式員工、支付的金額有多少，每個月都要申報，不再接受年度匯總申報。今年第四季開始會針對應盡申報義務的公司，展開執法檢查。
此外，個人有股權轉讓，也要合併在個人所得額裡，而且要求必須提報給大陸的工商部門，如果股權是用不合理的低價轉讓，國稅局也有可能重新核定。
大陸稅局為加強稅收徵管，將會利用企業逐月申報的扣繳細目，將企業帳上的薪資費用支出總額，和扣繳申報的金額調節比對，看兩者是否一致，而且為落實查核，還特別規定稅局進行比對的企業戶數，不能低於總申報總戶數10%。
雖然「全員全額扣繳申報」6月才正式實施，但成都等地區已經開始試點實施，而且只要去年扣繳稅款總額超過人民幣5萬元的企業，就要納入申報範圍。吳德豐呼籲，台商企業在大陸一定要誠實申報扣繳明細，個人也不要再心存漏報或低報所得的陋習，以免稅務風險增加。
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